波紋龍蝦和雜色龍蝦線粒體基因組特征及分子進(jìn)化研究.pdf

1、龍蝦類(lèi)(Palinura)屬甲殼綱(Crustacea)十足目(Ddcapoda)爬行亞綱(Reptantia)。形體較大、肉質(zhì)細(xì)嫩，滋味鮮美且外形五彩繽紛，因此具有較高的經(jīng)濟(jì)價(jià)值和觀賞價(jià)值，是我國(guó)福建，臺(tái)灣和廣東近海重要的漁業(yè)資源。本文以總DNA為模板采用步移PCR擴(kuò)增法測(cè)定了波紋龍蝦和雜色龍蝦的線粒體基因組全序列。并探討了龍蝦類(lèi)mtDNA分子進(jìn)化的特點(diǎn)，結(jié)果表明：
　　波紋龍蝦和雜色龍蝦mtDNA全序列長(zhǎng)度分別為15665 b

2、p和15700 bp，在GeneBank登錄號(hào)分別為JN542716和JQ320274。波紋龍蝦和雜色龍蝦線粒體基因組全序列的排列順序及組與其他一些物種線粒體相似：由13個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因(pxotein-coding genes，PCGs)、22個(gè)tRNA基因、2個(gè)rRNA基因(16sRNA和12sRNA)和一段A+T富集區(qū)組成。其中有14個(gè)基因位于輕鏈(L)上，分別為12sRNA，16sRNA，nad1，nad4L，nad4，nad5

3、，tRNAVal，tRNALeu-CUN，tRNAPro，tRNAHis，tRNAPhe，tRNACys，tRNATyr，tRNAGln其余23個(gè)基因位于重鏈(H)上。
　　兩種龍蝦的atp6與atp8之間和nad4與nad4L之間的重疊情況一致，均重疊7個(gè)堿基。除cox1和nad2，其余的11個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因都以標(biāo)準(zhǔn)的ATN作為起始密碼子，在其他物種的線粒體全序列中的起始密碼子使用情況與之相似。had2以GTG為起始密碼子，co

4、x1的起始密碼子是ACG，這在后生動(dòng)物中也曾見(jiàn)報(bào)道。除atp6、atp8、cox3、nad1、nad2、nad4L和nad6的終止密碼子是TAA外，其余的終止密碼子為不完全的T或TA，其轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的3’末端為U或UA，可在轉(zhuǎn)錄后加工過(guò)程中加接多聚腺苷酸尾巴，從而形成完整的UAA終止密碼子?？刂茀^(qū)是AT富集區(qū)，也是整個(gè)mtDNA中變異最大的區(qū)域。22個(gè)tRNA中，除了tRNASer(AGY)基因的二級(jí)結(jié)構(gòu)缺少DHU臂外，其余都為典型的三葉草