臘蛋白跨膜區(qū)相互作用的分子動力學模擬研究.pdf

1、分化抗原36(CD36)，血小板膜糖蛋白(Glycoprotein，GP)，DNAX激活蛋白12(DAP12)都是本實驗室研究的膜蛋白，它們在細胞膜上具有多種功能，作用十分關鍵。課題組使用多種生化實驗的方法來研究這些其跨膜區(qū)相互作用，已經得到了很多有重要意義的實驗數(shù)據。發(fā)現(xiàn)其跨膜區(qū)部分能通過相互作用在膜內發(fā)生寡聚現(xiàn)象，調控了膜內外的信號傳導。因此，使用分子動力學模擬方法來進一步研究跨膜螺旋如何在雙層膜中自組裝，并形成具有生物功能的寡聚復

2、合物。
　　 首先，使用全原子模擬的方法研究了CD36跨膜區(qū)1野生型和突變型G16I的裝配特性。發(fā)現(xiàn)G8對裝配影響非常低;G12對裝配影響略高于G8; G16和A20還有G23等3組氨基酸之間有強烈相互作用，對二聚裝配有關鍵作用。其突變體G16I不能形成穩(wěn)定二聚體。
　　 接著，通過全原子模擬方法觀察了GPIB-IX復合物跨膜區(qū)的裝配過程。發(fā)現(xiàn)復合物跨膜區(qū)中的幾個極性氨基酸的確主導了的寡聚。IBα通過靠近N端的Y492，

3、C端的A502和S503來與IBβN端的Q129和C端的H139裝配，而Ⅸ通過靠近N端的D135和C端的多個疏水氨基酸來與IBβN端的Q129和C端的疏水氨基酸裝配。
　　 最后，多次粗?；M了DAP12跨膜區(qū)的二聚裝配過程，獲得了量化的結果。發(fā)現(xiàn)在交叉角分布圖中，V42野生型的左手裝配出現(xiàn)的次數(shù)高于右手裝配，而且2個跨膜螺旋之間的接觸區(qū)域是很集中的，在隨后的全原子模擬結果中也證明了左手裝配是穩(wěn)定的裝配方式。非破壞性突變的確能