石榴皮對非酒精性脂肪肝病的基因表達調(diào)控數(shù)據(jù)分析.pdf

1、非酒精性脂肪肝病(Non-alcohol Fatty Liver Disease，NAFLD)是指除酒精和其他明確的損肝因素所致的肝細胞內(nèi)脂肪過度蓄積為主要特征的臨床病理綜合征?！岸未驌簟奔僬f中胰島素抵抗(Insulin resistance，IR)、氧化應激和脂質(zhì)過氧化是當前公認的NAFLD發(fā)病的關(guān)鍵因素。近年來，對NAFLD發(fā)病機制的研究很多，但是NAFLD具體的發(fā)病機制尚未明確。因此，對NAFLD發(fā)病機制的深入研究有利于更先進的

2、診斷及治療方法的發(fā)展。最近有研究發(fā)現(xiàn)石榴皮具有抗氧化、抑菌、抑制脂肪酸合成酶、調(diào)控肝細胞膽固醇的平衡和降血脂等效果。這些研究提示，石榴皮對NAFLD可能存在一定的治療效果。深入探討其對NAFLD影響的分子機制，可能幫助闡明其作用機制，為進一步研究提供參考。
　　本文首先從NCBI中的GEO數(shù)據(jù)庫中下載基因芯片數(shù)據(jù)集GSE66316。利用Qlucore Omics Explorer3.0(QOE3.0)軟件分析篩選“高脂飲食和石榴皮

3、飼養(yǎng)8周”和“高脂飲食飼養(yǎng)8周”基因芯片數(shù)據(jù)中的差異表達基因。然后，應用Database for Annotation,Visualization and Integrated Discovery(DAVID)對QOE3.0篩選出來的差異表達基因進行基因功能富集分析。最后，利用Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins(STRING)在線分析軟件，建立基因編碼蛋

4、白關(guān)系網(wǎng)絡(luò)圖。通過分析，最終確定石榴皮對NAFLD的基因表達調(diào)控主要集中在一系列差異表達基因;再進行文獻挖掘分析，發(fā)現(xiàn)石榴皮可能通過對幾個關(guān)鍵差異表達基因影響調(diào)節(jié)NAFLD的發(fā)生發(fā)展。
　　QOE3.0軟件分析篩選出172個差異表達基因。其中高表達基因118個，包括AAGAB、CAD、EXOC1、RPL10、TFB2M、RPS7、NHP2、TRUB1等;低表達基因54個，包括ISG15、OASL、NR3C1、AZGP1、BIRC5

5、、RGMA等。DAVID分析發(fā)現(xiàn)這172個差異表達基因主要涉及RNA結(jié)合、修飾與加工，核糖體及其復合物的生物合成，蛋白質(zhì)的轉(zhuǎn)運和定位，翻譯，一碳單位代謝，甲基化，GTPase的結(jié)合與活性結(jié)合，鈣離子結(jié)合，多糖結(jié)合，核苷三磷酸酶活性調(diào)節(jié)，轉(zhuǎn)錄輔激活因子的活性，轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合，核糖核蛋白復合體，線粒體，脂蛋白生物功能等生物過程、分子功能和細胞組分。將172個差異基因?qū)隨TRING中，最終篩選出13個差異表達基因。
　　對這13個基因進

6、行文獻挖掘和分析顯示:石榴皮對NAFLD的治療作用可能是通過上調(diào)LPL、CARM1、C1QBP、TFB2M等基因的表達，促進甘油三酯水解，減少其在肝臟中的蓄積;增強肝細胞的抗氧化應激能力以及維持線粒體功能的穩(wěn)定，進而維持肝細胞的正常生物代謝;同時，還可能下調(diào)NR3C1基因的表達，降低血液中游離脂肪酸的濃度，緩解胰島素抵抗，從而達到治療NAFLD的功效。而NHP2、RPL10、RPS7、CAD、PCK2、SG15、OASL、TR UB1基