從轉錄組和蛋白組水平研究大鼠再生肝的細胞增殖途徑和方式.pdf

1、本研究采用整合轉錄組和蛋白組的方法對大鼠肝再生(RatLiverRegeneration，RLR)的機理進行系統(tǒng)性分析?；蛭㈥嚵蟹治霭l(fā)現，3712個基因在大鼠肝再生中的表達差異顯著或極顯著，其中，2850個基因表達上調、816個基因表達下調和46個基因表達上/下調。蛋白質分析發(fā)現，2168種蛋白的表達差異顯著或極顯著，其中，1518種蛋白表達上調、411種蛋白表達下調和239種蛋白表達上/下調。上述基因和蛋白統(tǒng)稱為RLR相關基因或RL

2、R相關蛋白。其中，2381個RLR基因為基因組特有，775種RLR蛋白為蛋白組特有，在mRNA或/和翻譯水平上與肝再生相關并相對應的基因與蛋白，即RLR基因/蛋白2383種，其中，RLR基因1331個，RLR蛋白1393種。
　　在此基礎上，用已建立的數據庫和統(tǒng)計學方法，從細胞增殖的角度分析這些肝再生相關基因和蛋白表達變化在大鼠肝再生中預示的生物學意義。GeneOntology(GO)注釋發(fā)現，1009個RLR基因參與細胞增殖，5

3、06種RLR蛋白參與細胞增殖。對比上述基因和蛋白的表達變化發(fā)現，561個RLR基因未在蛋白組中查到,為基因組特有，89種RLR蛋白未在基因組中查到，為蛋白組特有，744種基因和蛋白相對應并在mRNA或/和蛋白水平上與肝再生相關，稱為RLR基因/蛋白。同時，606個RLR基因參與細胞增殖信號通路，279種RLR蛋白參與細胞增殖信號通路。譜函數（Ep(t)值）分析表明肝臟細胞的增殖主要與FGF、PDGF、INS、OSM、IL2和HRH3信號

4、傳導活動密切相關。上述6條信號通路涉及特有基因9個，特有蛋白3種，基因/蛋白23種。同時，利用網絡原理和方法結合同類提取法分析發(fā)現，磷脂酶Cγ2(phospholipaseCgamma2，PLCG2)是上述6條細胞增殖信號通路的匯集點。PLCG2的表達受轉錄和翻譯水平的雙重調控，在大鼠肝再生中起重要作用。
　　綜上所述，本研究通過生物高通量檢測結合網絡原理和方法分析了大鼠肝再生中基因和蛋白表達變化預示的細胞增殖信號通路對細胞增殖活