基于結構域組合信息預測蛋白質相互作用.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、結構域是蛋白質的結構和功能區(qū)域，在蛋白質相互作用過程中發(fā)揮重要作用。近年來，已出現(xiàn)多種從結構域水平預測蛋白質間相互作用的方法，這些方法大多基于結構域對之間發(fā)生相互作用的頻率特征建立預測模型。其不足在于，由于訓練樣本有限，只能獲取部分結構域對的出現(xiàn)頻率，從而無法完全預測待預測蛋白質對的相互作用關系。
　　 為了解決這個問題，本研究基于蛋白質間相互作用由多個結構域聯(lián)合作用導致的假設，提出了一種預測蛋白質相互作用的新方法。該方法基于結

2、構域組合對序列的氨基酸理化性質建立序列特征向量，并使用支持向量機對結構域組合對間相互作用關系進行分類預測，得到其序列特征值，同時采用統(tǒng)計分析的方法獲取其頻率特征值，最后融合上述兩種特征估計結構域組合間發(fā)生相互作用的可能性，并以此預測蛋白質間相互作用關系。
　　 經(jīng)過實驗測試，該方法對于酵母蛋白質相互作用關系的預測敏感度與預測專一性分別達到70%和62.8%。此外，對于所含結構域組合對具有顯著統(tǒng)計特征的蛋白質對，該方法的預測敏感度

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