中國(guó)明對(duì)蝦和日本囊對(duì)蝦的群體遺傳多樣性研究及幾種蟶類的分子系統(tǒng)學(xué)研究.pdf

1、本實(shí)驗(yàn)對(duì)簾蛤目四種蟶類大竹蟶(Solengrandis)，長(zhǎng)竹蟶(Solenstrictus)和小刀蟶(Cultellusattenuatus)和縊蟶(Sinonovaculaconstricta)的線粒體16SrRNA和COI基因片段部分序列進(jìn)行了比較并對(duì)其系統(tǒng)學(xué)進(jìn)行了初步研究。得到的序列總長(zhǎng)度分別為470-481bp(16S)和658bp(COI)。采用鄰接法(NJ)和最大簡(jiǎn)約法(MP)構(gòu)建分子系統(tǒng)樹。系統(tǒng)分析顯示，采用NJ法和MP

2、法構(gòu)建的系統(tǒng)樹表現(xiàn)出完全相同的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)。聚類分析顯示，大竹蟶和長(zhǎng)竹蟶聚為一支，小刀蟶和縊蟶聚為一支。四種蟶類線粒體16SrRNA和COI基因在不同種間其明顯的多態(tài)性差異，證實(shí)了16SrRNA和COI基因序列均普遍適用于蟶類種及以上階元的系統(tǒng)學(xué)遺傳多樣性分析。 本文采用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)技術(shù)對(duì)中國(guó)明對(duì)蝦(Fenneropenaeuschinensis)乳山灣、海洲灣、朝鮮西海岸和韓國(guó)南海4個(gè)自然群體78個(gè)個(gè)體的線粒體細(xì)胞色素

3、氧化酶I(COI)基因部分序列進(jìn)行了擴(kuò)增。PCR產(chǎn)物純化后測(cè)序，排序后得到長(zhǎng)度為840bp(不含引物)的序列，四個(gè)群體平均A，T，G，C含量分別為28.1％、36.8％、16.2％、18.9％，AT含量高于GC含量。MEGA軟件檢測(cè)到17個(gè)變異位點(diǎn)，其中有6個(gè)顛換核苷酸位點(diǎn)，其余都為轉(zhuǎn)換位點(diǎn)，共19種單倍型。4個(gè)群體擁有單倍型的數(shù)量相差不多，乳山灣群體、海洲灣群體，朝鮮西海岸群體和韓國(guó)南海群體的單倍型數(shù)分別為4個(gè)、5個(gè)，4個(gè)和6個(gè)。各群

4、體遺傳距離在0.00066-0.00131之間。在多態(tài)位點(diǎn)數(shù)S、平均核苷酸差異數(shù)K和核苷酸多樣性指數(shù)Pi三個(gè)指標(biāo)上，韓國(guó)南海群體的值相對(duì)較高，朝鮮西海岸群體次之，其次為海洲灣群體，乳山灣群體最低。用AMOVA軟件計(jì)算出群體間差異為13.63％，群體內(nèi)部差異為87.37％，表明主要的遺傳變異來自于群體內(nèi)部。P值檢驗(yàn)結(jié)果表明，中國(guó)明對(duì)蝦乳山灣群體和海洲灣群體沒有明顯的遺傳分化，韓國(guó)南海群體和其它三個(gè)群體有顯著的遺傳分化，利用COI序列構(gòu)建的

5、UPGMA分子系統(tǒng)樹顯示各群體沒有明顯的聚類。結(jié)果表明4個(gè)群體中以韓國(guó)南海群體的遺傳多樣性最高，其次為朝鮮西海岸群體和海洲灣群體，乳山灣群體群體的遺傳多樣性最低。從整體水平來看，中國(guó)明對(duì)蝦群體的遺傳多樣性水平偏低。 本研究對(duì)取自福建沿海地區(qū)的日本囊對(duì)蝦的COI基因序列進(jìn)行了PCR擴(kuò)增，得到了850bp左右的清晰帶，COI序列排序后長(zhǎng)度為858bp(不含引物)，A，T，G，C含量分別為27.1％、36.1％、16.7％、20.1％