湖州市結核分枝桿菌基因分型特征研究.pdf

1、目的：
　　 結核病是嚴重威脅人類健康的傳染病之一。近年來，由于不少地區(qū)和國家忽視對結核病的控制，以及臨床抗結核藥物的不規(guī)范應用所導致的耐藥尤其是耐多藥(MDR)病例的大量出現(xiàn)，再加上免疫缺陷病毒(HIV)/艾滋病(AIDS)合并結核病的感染，導致結核病發(fā)病數(shù)不斷增加，結核病疫情不斷惡化。為此，本次研究了解湖州市結核分枝桿菌基因型及其特征，查找主要流行株，分析流行趨勢，研究基因型成簇特征與結核病流行傳播的關系，建立湖州市結核病患

2、者資料庫以及結核分枝桿菌DNA基因信息數(shù)據(jù)庫，探討結核分枝桿菌基因分型在結核病控制中的應用價值，為有效控制結核病提供科學依據(jù)。
　　 方法：
　　 A.選例：以湖州市2007年1月1日至2007年6月31日期間發(fā)現(xiàn)的菌陽結核病患者作為研究對象，并對結核分枝桿菌分離鑒定。
　　 B.基因分型：采用MLVA基因分型方法，對結核分枝桿菌的15個VNTR位點進行引物設計、PCR擴增、瓊脂糖凝膠電泳凝膠成像，利用Quant

3、ity one進行圖像數(shù)據(jù)和基因信息數(shù)字化處理。
　　 C.資料庫建立：建立結核病患者資料庫和DNA全基因庫。
　　 D.數(shù)據(jù)分析：利用BioNumerics4.5軟件對基因數(shù)字化信息進行聚類分析。采用spss13.0統(tǒng)計軟件對相關資料進行統(tǒng)計分析。
　　 結果與結論：
　　 A.180結核病患者中，男119例，女61例，男：女=1.95:1；最大年齡87歲，最小14歲；25-44歲年齡組所占比例較高，為

4、44.4％(80/180)；職業(yè)組中，農民69例，占38.3％(69/180)；民工64例，占35.6％(64/180)；商業(yè)與服務業(yè)15例，占8.3％(15/180)；治療分類中，初治病例160例，占88.9％(160/180)，復治比例20例，占11.1％(20/180)。
　　 B.在15個VNTR位點中，Mtub-21、Mtub-39具有高的多態(tài)性；ETR-A、MIRU-10、MIRU-40、Mtub-30具有中等的多態(tài)

5、性，而其它位點具有較差的多態(tài)性。
　　 C.180株結核分枝桿菌共有93個基因型，可分為7個基因群，其中a群占2.2％，b群占5.0％，C群占2.2％，d群占9.4％、e群占9.4％、f群占6.7％，g群占65.0％。g群結核分枝桿菌為湖州市主要的流行株。
　　 D.180株結核分枝桿菌共有93個基因型，其中62株為單一基因型，占34.4％(62/180)。118株為成簇株，分別屬于31個簇，每簇含菌株2-26株，平均3

6、.81株。含26株的共1簇，為最大簇；含7株的共1簇；含6株的共1簇；含5株的共1簇；含4株的共6簇；含3株的共8簇；含2株的共13簇。180株結核分枝桿菌成簇率為65.6％(118/180)。
　　 E.不同人群結核分枝桿菌基因型特征為，119例男性患者中結核分枝桿菌成簇率為67.2％(80/119)，61例女性患者結核分枝桿菌成簇率為62.3％(38/61)，不同性別之間的成簇率無統(tǒng)計學意義(x2=0.43，P>0.05)；

7、年齡組中14-44歲和45-64歲結核病患者結核分枝桿菌成簇率分別為76.9％(83/108)、70.3％(26/37)，均顯著高于65歲以上年齡組成簇率(25.7％)(x2=39.99，P<0.05；x2=18.32，P<0.05)；職業(yè)分布中，民工、商業(yè)與服務業(yè)、工人、農民結核分枝桿菌成簇率分別為78.1％(50/64)、86.7％(13/15)、67.0％(12/18)、50.7％(35/69)。統(tǒng)計結果顯示，民工、商業(yè)與服務業(yè)、

8、工人相對于農民成簇率更高，并具有統(tǒng)計學意義。按患者登記分類，初治組患者結核分枝桿菌成簇率顯著高于復治組(x2=7.06，P<0.05)。
　　 綜上所述，采用MLVA基因分型方法對180株結核分枝桿菌進行基因分型，結果證實湖州市結核分枝桿菌分離株基因型具有多態(tài)性；15個VNTR位點中，Mtub-21、Mtub-39、ETR-A、MIRU-10、MIRU-40、Mtub-30是分析湖州市結核分枝桿菌基因型的首選位點。根據(jù)被檢結核分