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文檔簡介
1、背景:
結(jié)核分枝桿菌(MTB)作為結(jié)核病的病原菌,一直以來危害著人類的健康。具WHO最新統(tǒng)計,目前全球每年新增活動性結(jié)核病患病人數(shù)約為1040萬,年死亡人數(shù)約為140萬,全球有超過1/3的人口感染過結(jié)核分枝桿菌,同時隨著合并HIV感染和多重耐藥病例的增多,結(jié)核病的防治形勢十分嚴峻。尋找快速、準確、靈敏、特異的試驗方法,對于結(jié)核病的防治有著十分重大的意義。IGRA是近些年發(fā)展起來的結(jié)核病診斷方法,有大量的文獻報道,該方法對于結(jié)核
2、病的診斷特異而靈敏。IGRA中運用了結(jié)核分枝桿菌兩種特異性蛋白ESAT-6和CFP-10作為診斷性抗原,檢測靶細胞釋放IFN-γ的量,從而判斷受檢者的感染情況。其中釋放IFN-γ主要是CD4+T淋巴細胞,然而,目前對于ESAT-6和CFP-10的刺激后CD4+T淋巴細胞釋放IFN-γ的作用機制和其中的具體差異表達基因研究較少。
目的:
利用全基因組表達譜芯片篩選ESAT-6和CFP-10刺激結(jié)核患者外周血CD4+T淋
3、巴細胞前后差異表達基因,并分析刺激過程中可能參與的信號通路的變化,為進一步研究結(jié)核病的發(fā)病機制提供依據(jù)。
方法:
抽取3例初診結(jié)核患者外周靜脈血各10 ml,密度梯度離心法分離獲得PBMC,分別以ESAT-6和CFP-10刺激PBMC,6 h后運用磁珠分選法分選CD4+ T淋巴細胞,運用基因表達譜芯片篩選刺激前后差異表達基因,并進行生物信息學分析,同時使用q-RT PCR驗證部分差異表達基因。
結(jié)果:
4、> 1.ESAT-6刺激前后基因表達譜芯片共篩選出2297個差異表達基因,其中上調(diào)基因1071條,下調(diào)基因1226條(>2倍變化且P<0.05)。信號通路分析顯示這些差異表達的基因參與了17條信號通路的調(diào)控,其中JAK-STAT信號通路,Toll樣受體信號通路,NF-κB信號通路,MAPK信號通路,PI3K-AKT信號通路等5條信號通路與結(jié)核釋放IFN-γ關(guān)系密切。
2.CFP-10刺激前后基因表達譜芯片共篩選出2954個差
5、異表達基因,其中上調(diào)基因1360條,下調(diào)基因1594條(>2倍變化且P<0.05)。信號通路分析顯示這些差異表達的基因參與了21條信號通路的調(diào)控,其中JAK-STAT信號通路,Toll樣受體信號通路,T細胞受體信號通路,MAPK信號通路,TGF-β信號通路等5條信號通路與結(jié)核釋放IFN-γ關(guān)系密切。
3.q-RT PCR實驗證實7種差異基因表達趨勢與芯片結(jié)果一致。
結(jié)論:
ESAT-6和CFP-10刺激后的
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