弓形蟲熒光定量PCR檢測方法及HRM分型方法的建立.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、弓形蟲病(Toxoplasmosis)是一種呈世界性分布的人獸共患寄生性原蟲病,病原是真球蟲目、肉孢子蟲科、弓形蟲屬的剛地弓形蟲(Toxoplasma gondii)。該蟲可寄生在幾乎所有溫血動物的有核細胞內,嚴重危害人類的健康及畜牧業(yè)的發(fā)展。研究報道:國內豬的弓形蟲感染率從12%~100%不等,病死率可達60%以上。弓形蟲病正嚴重危害著中國養(yǎng)豬業(yè)的健康發(fā)展。目前,該蟲有三個國際公認的傳統(tǒng)基因型,即TypeⅠ型、Ⅱ型和Ⅲ型,其中Type

2、Ⅰ型為強毒基因型,Ⅱ型和Ⅲ型為弱毒基因型。本論文選取TypeⅠ型標準蟲株RH株,Ⅱ型標準蟲株PRU株及Ⅲ型標準蟲株VEG株作為研究對象,以致密顆粒蛋白7(GRA7)基因為靶基因,建立弓形蟲病的熒光定量PCR檢測方法及弓形蟲三種標準蟲株HRM基因分型方法,為弓形蟲的分子生物學檢測、種群遺傳學及流行病學調查奠定基礎。
  為建立一種弓形蟲病的快速檢測方法,在弓形蟲致密顆粒蛋白7(GRA7)基因種內保守的區(qū)域設計種特異性引物,建立弓形蟲

3、病的熒光定量PCR檢測方法,并應用于臨床檢測。結果顯示,該檢測方法特異性強,除弓形蟲陽性樣品出現擴增外,豬等孢球蟲、豬附紅細胞體、新孢子蟲、犬鉤蟲、貓藍氏賈第蟲等沒有擴增;操作簡單、快速、從提取樣品基因組到出檢測結果全程需時大概100 min左右;敏感度高、最低可以檢測到含1個拷貝靶基因的陽性質粒及含10個速殖子的臨床樣品;穩(wěn)定性好,組內及組間Ct值的變異系數(CV)均小于2%。用所建立的檢測方法對廣東地區(qū)9個規(guī)?;l(fā)病豬場送檢的360

4、份臨床樣品進行檢測并結合抽樣測序,結果顯示該地區(qū)這幾個規(guī)?;i場的弓形蟲感染率較高,樣品陽性率高達63.0%,同時提醒養(yǎng)殖場畜主要正確及時使用藥物進行控制,加強監(jiān)測,避免爆發(fā)式發(fā)病。該方法對豬弓形蟲病的流行病學調查及其防治具有一定意義。
  為建立一種弓形蟲三種蟲株的快速基因分型方法,本研究選取弓形蟲致密顆粒蛋白7(GRA7)作為靶基因,采用HRM技術對國際公認的三個傳統(tǒng)基因型的標準蟲株(TypeⅠ型RH株、Ⅱ型PRU株和Ⅲ型VE

5、G株)進行基因分型。結果顯示,本研究所設計的引物HRM-F和HRM-R,在優(yōu)化的反應條件下能明顯區(qū)分TypeⅠ型、Ⅱ型和Ⅲ型。HRM分型方法的穩(wěn)定性試驗結果顯示、三次的組內和組間重復性均良好;敏感性試驗結果顯示,當樣品濃度低至5×10-4 ng/μL時,HRM分型方法依然可以辨別出基因型。用所建立的分型方法對9份臨床陽性樣品進行檢測,結果顯示4份人源樣品和1份魚源樣品為TypeⅡ型,可信度90.82%以上;2份猴源樣品為TypeⅠ型,可

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