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文檔簡介
1、香魚(Plecoglossus altivelis)為一種集約化養(yǎng)殖的名貴魚類,養(yǎng)殖前景廣闊。實踐中發(fā)現(xiàn)香魚性成熟后雌雄個體之間存在性別生長相關二態(tài)性(sexual size dimorphism),雌魚銷售價格比雌雄混合銷售高出一倍以上。為提高香魚養(yǎng)殖效益,采用染色體操作技術研究香魚的雌核發(fā)育,采用AFLP分子標記技術篩選獲得一條雄性性別特異性標記并轉化為SCAR標記,采用轉錄組測序技術(RNA-seq)研究分析了繁殖季節(jié)相關基因在性
2、腺中的表達,進一步采用RT-PCR分析了性腺發(fā)育相關基因(foxl2、dax1、tra2和vasa)在成魚組織中的表達。結果如下:
香魚雌核發(fā)育誘導以靜水壓法最佳,15日齡子代存活率為(15.2±8.2)%。SSR標記分析表明靜水壓法可以通過抑制第二極體排出誘導香魚雌核發(fā)育,雌核發(fā)育子代比例為87.5%。SRAP標記K-group引物組合在母本中擴增出母本特有條帶4條,父本特有條帶3條,子代樣本條帶分布狀況基本符合孟德爾定律;
3、P-group引物組合在母本中僅能擴增出1條帶,無特異性,父本擴增出特有條帶7條。No.7和No.14樣本檢測到父本特有條帶,屬于非雌核發(fā)育子代魚苗。與微衛(wèi)星標記相比,SRAP標記可通過一次反應可同時實現(xiàn)對香魚基因組多個位點檢測,獲得更多的遺傳信息。
香魚性別相關標記篩選結果表明:63對AFLP選擇引物擴增出3733條清晰條帶,平均每組引物獲得清晰帶59條。其中E-ATG/M-CTG引物組合擴增出一條大小為139bp的雄性特異
4、性條帶,轉化為SCAR標記后命名為ayu102。12尾野生香魚檢測發(fā)現(xiàn)總計發(fā)現(xiàn)6條擴增片段,其中5個片段(分別命名為:a、b、c、d和e)只在雄性個體中擴增獲得;一條片段(命名為:f)在雌雄個體均出現(xiàn),片段e和f序列同源性為96.67%。ayu102性別標記有效性檢測采用45日齡養(yǎng)殖群體、野生群體和雌核發(fā)育群體。結果顯示片段e出現(xiàn)于所有的雄性個體中,養(yǎng)殖雌性群體出現(xiàn)片段e的頻率為6.7%。表明ayu102標記可用于香魚性別鑒定研究,并對
5、揭示香魚性別決定系統(tǒng)具有重要的意義。
香魚繁殖季節(jié)性腺轉錄組測序總共獲得46829個unigene,精巢、卵巢分別獲得43125、46455個unigene。功能注釋獲得5348個GO items,1053個酶和279個KEGG途徑,共有2846個基因注釋到24個COG分類中。精巢、卵巢間存在大量差異表達基因。精巢高表達基因83個,除核糖體相關基因外,RPKM最高的前10個基因分別是微管蛋白、延伸因子-1、早期內(nèi)體抗原1、冷誘
6、導rRNA結合蛋白、肌酸激酶、肽酰脯氨酰異構酶、熱激蛋白70kDa、鳥嘌呤核苷酸結合蛋白、增殖細胞核抗原基因、熱激蛋白90。卵巢高表達基因42個,RPKM最高的前10個基因分別為N-myc原癌基因、NAD(P)H脫氫酶、脂肪酸結合蛋白、微管蛋白、組蛋白H2A、延伸因子1、細胞周期蛋白A/B、熱激蛋白70kDa、核轉運蛋白、核糖體蛋白。精巢差異基因主要與細胞內(nèi)物質(zhì)運輸、蛋白質(zhì)轉錄翻譯、精子形成、脂肪酸代謝等相關;卵巢差異表達基因主要與信號
7、傳導、膜泡運輸、類固醇激素代謝、脂肪酸代謝、介導免疫應答等相關。
香魚dax1基因cDNA長度為1150 bp,編碼266個氨基酸,與斑馬魚(Danio rerio)的同源性最高為62%;tra2基因 cDNA長度為1821 bp,編碼320個氨基酸,與慈鯛(Pundamilia nyererei)的同源性最高為77.8%;foxl2基因cDNA長度為2290 bp,編碼305個氨基酸,與虹鱒(Oncorhynchus myk
8、iss)的同源性最高為94.7%;vasa基因cDNA長度為6099bp,編碼612個氨基酸,與大西洋鮭(Salmo salar)的同源性最高為74.3%。dax1基因表達模式存在性別相關二態(tài)性,在肌肉中表達水平最高。tra2基因在各組織中均能檢測到表達信號,雌雄組織表達量無顯著差異。foxl2基因的表達模式存在顯著性別相關二態(tài)性,主要在在雌性卵巢、心臟和肌肉組織中表達。vasa基因在精巢中表達量顯著高于卵巢,除肝臟組織外,其他組織均能
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