快速有限階Burrows-Wheeler變換的算法設計及應用.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、本文基于對一種新的ST逆變換算法的分析，實現了快速ST正向變換算法，并將兩者結合實現了一個快速有限階BWT算法。此算法實現的目的在于驗證新逆ST算法的可行性及其能否保持ST正向變換相對于BWT的時間復雜度優(yōu)勢，同時使新的逆ST算法能夠實際應用。ST是針對BWT正向變換中超線性排序時間復雜度改進的一個BWT變種?，F存逆ST算法由于采用了哈希表而導致了較高的復雜度，影響了sT正向變換帶來的優(yōu)勢。新的逆ST算法的提出使得ST正向變換相對于BW

2、T的優(yōu)勢能得以保持。因此要驗證新的逆ST算法的理論意義，ST正、逆變換的快速實現尤為關鍵。實現sT正向變換的主要難點是如何在線性的復雜度內實現正向變換中的排序操作。本文采用了一種改進的基數排序來解決此問題。為了驗證新的逆ST算法的可行性，本文對所實現的快速有限階BWT算法與無限階BWT算法進行對比實驗，在Calgary數據集上進行驗證和性能分析。實驗數據表明新的快速有限階BwT算法可在保持壓縮率為無限階BWT算法的99.83﹪的同時，提

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