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文檔簡介
1、幽門螺桿菌(H.pylori)是人類常見的致病菌之一,是一種可長期定植于人類胃粘膜的革蘭氏陰性螺旋形微需氧菌,在全世界范圍內感染率超過50%。已證實,H.pylori感染是慢性胃炎、消化性潰瘍發(fā)生的主要病因,并與胃癌、胃粘膜相關淋巴樣組織(MALT)淋巴瘤的發(fā)生密切相關;其重要毒力因子細胞毒素相關基因A蛋白(CagA)是經(jīng)cag致病島編碼的Ⅳ型分泌系統(tǒng)注入到宿主細胞內并發(fā)揮毒性作用。目前,cag致病島編碼基因的功能及其致病機理尚未完全明
2、確。因此,本文以cag致病島中的cagI基因為研究對象,通過分子生物學、免疫學及微生物學等技術探討cagI基因的功能,旨為深入研究cag致病島的致病機理奠定基礎。
方法:
1.根據(jù)GenBank收錄的H.pylori26695全基因序列,利用生物信息學軟件Primer5.0自行設計cagI基因引物,獲得cagl基因,T-A克隆后構建pMD18-T-cagI載體,測定序列;應用DNA Star、Clustal1
3、.8及Merga4.0對其核苷酸及蛋白序列進行生物信息學分析研究,構建系統(tǒng)進化樹。
2.構建pET-28a-cagI原核表達載體,轉化表達宿主菌BL21(DE3);經(jīng)IPTG誘導后,SDS-PAGE電泳和Western Blot方法鑒定表達CagI蛋白,并以Ni2+-NTA柱分離純化目的蛋白;純化后的CagI融合蛋白免疫家兔,制備抗CagI多克隆抗體,應用酶聯(lián)免疫吸附試驗(ELISA)檢測血清抗體效價。
3.
4、收集H.pylori,重懸并裂解菌體,經(jīng)高速離心分離得到各菌體組分蛋白,包括周質間隙蛋白、胞質蛋白及膜蛋白(包括內膜和外膜),利用Western Blot法檢測CagI蛋白的亞細胞定位。
4.收集H.pylori感染的GES-1細胞,重懸裂解,并分離細胞組分,WesternBlot法檢測CagI蛋白的轉運。
5.將上述方法分離的H.pylori細菌膜組分與CagI多抗及Protein G瓊脂糖珠子相孵育做免疫
5、共沉淀并用Western Blot法檢測互作蛋白及Cagl蛋白的存在,將His-CagI大腸桿菌細胞總蛋白裂解產(chǎn)物與上述H.pylori亞細胞分離膜組分混合,加入到鎳柱珠子中做Pull-down實驗,分析與CagI互作的蛋白,MALDI-TOF質譜鑒定互作蛋白。
6.參考cagl基因測序結果,PCR擴增cagI基因編碼區(qū)兩側翼序列,作為同源臂片段,構建出帶卡那霉素抗性標志的打靶載體pBluescript/ΔcagI∷KMr
6、,采用電穿孔法將載體pBluescript/ΔcagI∷KMr轉化入受體菌株NCTC11637中,并經(jīng)PCR驗證后獲得了cagI基因缺失株,同理構建出cagL基因缺失株(陽性對照)。
7.cagI基因的缺失株與野生株分別與胃上皮細胞GES-1進行共培養(yǎng)后,檢測其對CagA蛋白轉運及其對細菌粘附作用的影響。
8.應用統(tǒng)計軟件SPSS11.0分析數(shù)據(jù),以均數(shù)±標準差表示,兩組之間的比較采用t檢驗。
7、結果:
1.擴增獲得的cagI基因全長1086bp,編碼361個氨基酸,獲得GenBank登錄號為HM126476。其核苷酸序列與兩株國際標準菌株(H.pylori26695及J99)同源性分別為98.3%和98.1%,其氨基酸序列與H.pylori26695同源性高達99.5%,基于核苷酸及氨基酸序列的系統(tǒng)進化樹也說明了其同源性。DNA Star軟件預測其編碼蛋白相對分子量為39.37kDa;
2.構建獲得
8、了原核表達載體pET-28a-cagI,IPTG誘導后,經(jīng)SDS-PAGE鑒定和Western Blot鑒定有目的蛋白表達;采用Ni2+-NTA柱梯度洗脫后,分離獲得了目的蛋白CagI;CagI融合蛋白免疫家兔,獲得了抗Cagl多克隆抗體,其效價為1:1.6×105:
3.Western Blot結果顯示CagI蛋白定位于菌體膜(包括內膜和外膜)上;CagI蛋白轉運實驗結果表明CagI蛋白沒有轉運到宿主細胞內,而陽性對照C
9、agA蛋白轉運到了宿主細胞內;免疫共沉淀、Pull-down及MALDI-TOF質譜實驗結果表明CagI蛋白與CagA蛋白有相互作用;
4.PCR法擴增得到用于同源重組的cagI基因的同源臂片段F1(612 bp)和F2(796 bp),同時得到了cagL基因的同源臂片段F1’(651 bp)和F2’(666 bp),并分別與pBluescript SKⅡ(-)載體(帶卡那霉素抗性基因的載體)相連接,構建出pBluescr
10、ipt/ΔcagI∷KMr和pBluescript/ΔcagL∷KMr載體;采用電穿孔技術將載體轉化進入野生株NCTC11637菌體內,在含卡那霉素的哥倫比亞平板上篩出cagI基因及cagL基因的突變株,并用PCR方法及測序鑒定突變株;
5.缺失株及野生株分別與胃上皮細胞GES-1共培養(yǎng)后,發(fā)現(xiàn)cagI基因缺失株處理組,CagA蛋白轉運明顯降低,而cagL基因缺失株處理組,胃上皮細胞內未能檢測到CagA的轉運;菌落形成實驗
11、表明cagI基因缺失后細菌的粘附功能下降。
結論:
1.成功克隆cagI基因,明確該基因是H.pylori cag致病島編碼的Ⅳ型分泌系統(tǒng)結構基因之一,經(jīng)生物信息學分析其核苷酸序列及氨基酸序列相對保守。
2.構建了cagI基因的原核表達載體pET-28a-cagI,獲得并純化了在大腸桿菌中異源表達的重組CagI蛋白,制備了抗CagI的多克隆抗體。
3.明確了CagI蛋白為一種膜相關
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