雞ESRα基因SNPs分析及其與早期產蛋性能關系的研究.pdf

1、雌激素受體(ESR)是一種與特異激素應答DNA元件相結合的激活轉錄因子，有ESRα、ESRβ兩種亞型，它廣泛存在于各種動物體內，具有轉錄調控蛋白質的功能，能影響雌激素基因在雌性脊椎動物組織的表達與調控，從而對雌性繁殖周期中卵泡的生長發(fā)育發(fā)揮作用。 本研究采用候選基因法，以中國優(yōu)良地方雞種文昌雞(n=160)作為試驗雞群，巴布考克雞(n=99)作為對照雞群，將ESRα基因作為雞產蛋性狀的候選基因，根據GenBank上登陸的雞ESR

2、α序列(GenBankAccessionNo.NC006090)，設計14對引物，擴增出ESRα基因的所有外顯子、5’側翼調控區(qū)和第1內含子部分序列，采用PCR-SSCP方法檢測基因變異，尋找雞ESRα基因的單核苷酸多態(tài)性位點(SingleNucleotidePolymorphisms，SNP)，并分析ESRα基因多態(tài)性與文昌雞產蛋性狀的相關性。 經PCR-SSCP檢測發(fā)現文昌雞和巴布考克雞ESRα基因的整個編碼區(qū)均未出現多態(tài)，

3、僅在第5外顯子兩雞群有所差異。克隆測序比對后發(fā)現巴布考克與GenBank上的序列有1處A126G堿基差異，是一個同義突變；文昌雞有1處T128C堿基差異，導致編碼的氨基酸發(fā)生變化，即Leu43Ser。5’側翼調控區(qū)文昌雞檢測到兩種基因型，雜合型堿基序列有4個SNPs：A-34G，T-76C，T-79C，C-102T。第1內含子(外顯子2上游約300bp的序列)存在多態(tài)性，其中巴布考克雞有2個SNPs位點，分別是：T122C，C169T。

4、文昌雞3個SNPs位點，分別是：T122C，A155G，C169T。A155G的堿基突變使內含子1序列中出現了TCTAGATCTTC的重復序列，使150-160bp處新增了與130-140bp處的酶切位點完全一致的XbaⅠ、BfaⅠ、BgⅢ、BstYI、Sau3AI、DpnI等6個酶切位點。 群體遺傳分析表明，5’側翼調控區(qū)文昌雞的兩種基因型頻率分別為CC型0.794、CD型0.206，兩個等位基因頻率分別是C為0.897、D為

5、0.103，C等位基因在群體中占絕對優(yōu)勢。經χ2檢驗，文昌雞群體在此突變位點處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)。兩種基因型與產蛋性狀的關聯分析表明，在文昌雞的早期產蛋性能(開產日齡、開產蛋重、40周齡產蛋重、40周齡產蛋量)上CC型與CD型間沒有顯著差異。在內含子1處巴布考克雞檢測到的三種基因型頻率分別為MM0.151、MN0.586、NN0.263；等位基因頻率M為0.444，N為0.556。經χ2檢驗，巴布考克雞群體處于Har

6、dy-Weinberg平衡狀態(tài)。文昌雞三種基因型頻率分別為EE0.187、EF0.580、FF0.233；等位基因頻率E為0.477，F為0.523。經χ2檢驗，文昌雞群體處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)。與產蛋性狀的關聯分析表明，在開產日齡、開產蛋重和40周齡產蛋重上三種基因型之間差異不顯著，而在40周齡產蛋量上EF、FF型均極顯著大于EE基因型(P＜0.01)，雜合型EF與FF基因型之間也存在顯著差異(P＜0.05)。結果表