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文檔簡介
1、作為人類基因組重要的表觀遺傳現(xiàn)象,DNA甲基化是基因表達調(diào)控中常見而又重要的機制,參與細胞分化與增殖、生物體老化、腫瘤發(fā)生等多種重要的生命活動。DNA甲基化狀態(tài)的檢測是腫瘤類型鑒別診斷的輔助手段,可用于癌癥發(fā)生的抑癌基因特異性失活的檢測。新一代測序技術可以實現(xiàn)全基因組單堿基分辨率的甲基化檢測,但是測序方法相對昂貴,采用計算的方法對DNA甲基化進行預測成為當前DNA甲基化生物信息學研究的熱點。
本文構建了預測DNA甲基化狀態(tài)的三
2、種神經(jīng)網(wǎng)絡模型,結(jié)果表明,與已有的模型相比,提高了DNA甲基化的預測準確率。本文主要工作如下:
(1)利用人工神經(jīng)網(wǎng)絡模型預測DNA甲基化狀態(tài)。使用人工手段組合不同的DNA甲基化特征,訓練人工神經(jīng)網(wǎng)絡模型,預測DNA甲基化狀態(tài)
(2)利用深度神經(jīng)網(wǎng)絡和卷積神經(jīng)網(wǎng)絡預測DNA甲基化狀態(tài)。使用DNA甲基化的全部特征信息,分別構建5層的深度神經(jīng)網(wǎng)絡模型和4層的卷積神經(jīng)網(wǎng)絡模型預測DNA甲基化狀態(tài)。
(3)利用深度
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