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文檔簡介
1、基因表達數(shù)據(jù)和腫瘤的關系已經被廣泛地研究,無監(jiān)督學習方法如聚類算法一般被用在功能基因組學,但是監(jiān)督學習方法能夠直接作用于有分類屬性的基因表達數(shù)據(jù)?;蛭㈥嚵蟹治龊头诸愐呀涀兂稍\斷腫瘤和癌癥的有效方式。但是早先的研究表明,在基因分類和癌癥診斷上,基礎的簡單分類模型有自己的缺點,同時在數(shù)據(jù)挖掘領域,分類器的集成技術受到了人們越來越多的關注。
在本文中主要選用AdaBoost算法創(chuàng)建分類器,來處理基因分類問題,這一算法是原始的Boo
2、sting思想的一個擴展實現(xiàn)。為了選擇合理的最有分類信息的基因子集,采用了BeliefF,F(xiàn)CBF,PCA等三種特征選擇算法。也應用了其他分類算法包括決策樹,支持向量機和Bagging以評估AdaBoost算法的效果。為了更好地分析迭代次數(shù)對結果的影響,通過解析WEKA中該算法的toString方法得到了算法的實際迭代次數(shù)。在兩個真實基因表達數(shù)據(jù)集上采取10折交叉驗證的方式進行試驗。
通過調整特征選擇算法、選取不同的特征個數(shù)、
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