4個位點單核苷酸多態(tài)性與冠心病易感相關性研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、冠心病是最常見的心血管疾病之一,是由環(huán)境因素和遺傳因素相互作用引起的一類復雜性多基因遺傳性疾病。近年來,隨著基因測序技術突飛猛進的發(fā)展以及越來越廣泛的應用,單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphisma,SNP)已成為醫(yī)療技術研究的熱點。尤其自2007年以來,全基因組關聯(lián)研究(genome-wideassociation study,GWAS)已發(fā)現(xiàn)與冠心病發(fā)病相關的多個多態(tài)性位點,為冠心病的易感人群及患

2、者的預防、診斷及治療提供了新的依據(jù)。但這些多態(tài)性位點對不同的人群冠心病的影響尚不清楚,大多數(shù)位點影響冠心病發(fā)生的機制尚不明確。本文根據(jù)GWAS的研究結果篩選出了rs515135、rs1122608、rs6544713、rs216172這四個位點進行冠心病基因單核苷酸多態(tài)性研究。與這四個位點相關的基因分別為APOB基因,LDLR基因,ABCG5-ABCG8基因,SMG6基因。
  目的:
  本研究目的在于對延邊漢族人群rs5

3、15135、rs1122608、rs6544713、rs216172四個單核苷酸多態(tài)性位點進行分析,探討這四個SNPs位點的等位基因頻率、基因型頻率與冠心病易感性的相關性,同時研究SNPs位點與臨床各參數(shù)的相關性,從而為進一步明確延邊漢族人群冠心病的發(fā)病機制、評估冠心病病變程度以及判斷冠心病預后提供新的治療目標。
  方法:
  1.研究對象
  本文采用病例對照研究方法,收集延邊地區(qū)漢族冠心病患者及其同期年齡、性別相

4、匹配的正常漢族人群共405例。其中病例組標本204例,選自2014年3月至2015年11月的漢族冠心病患者,其在延邊大學附屬醫(yī)院心血管內科確診并住院治療,年齡34-81歲,平均年齡64.7±9.9歲,男119例,女85例。選擇同期在延邊大學附屬醫(yī)院體檢科健康體檢的漢族正常人群為對照組,共201例,年齡50-88歲,平均年齡64.8±9.3歲,男111例,女90例。
  2.候選基因和SNPs位點的選擇
  本文研究意在根據(jù)G

5、WAS在冠心病易感性中的研究結果.同時結合查閱大量相關文獻,共篩選出rs515135、rs1122608、rs6544713、rs216172這四個位點進行研究。
  3.SNPs位點檢測方法
  采用基于熒光標記單堿基延伸原理的SNaPshot技術進行SNP的分型檢測,檢測過程主要包括引物設計合成、DNA提取、預擴增、預擴增產物純化、延伸反應、延伸產物純化,最后上機檢測進行數(shù)據(jù)分析。
  結果:
  (1)臨床

6、參數(shù)
  冠心病組204例,平均年齡64.7±9.9歲,其中男119例,女85例。正常對照組共201例,平均年齡64.8±9.3歲,男111例,女90例。兩組別之間高血壓、吸煙史、HDL、LDL有統(tǒng)計學意義(P<0.05),而年齡、性別、BMI、收縮壓、舒張壓、糖尿病史、TG、TC無統(tǒng)計學意義。
  (2)Hardy-Weinberg平衡檢驗
  APOB基因rs515135位點、LDLR基因rs1122608位點、S

7、MG6基因rs216172位點這3個SNP均符合Hardy-Weinberg平衡檢驗,表明本研究所選取的樣本具有較好的群體代表性。
  (3)冠心病組與對照組之間的相關分析結果
 ?、賰山M間等位基因頻率的相關分析:LDLR基因的rs1122608位點的等位基因頻數(shù)在冠心病組和對照組之間有顯著的統(tǒng)計學差異(P=0.005,P<0.01)
 ?、趦山M間基因型頻率的相關分析:SMG6基因的rs216172位點的三種基因型頻率

8、在冠心病組和對照組之間有統(tǒng)計學差異(P=0.009,P<0.05),說明該位點與冠心病有關聯(lián)。
 ?、蹆山M間基因模型模擬的基因型頻率的相關分析:通過模擬基因模型,當SMG6基因的rs216172位點的等位基因G為顯性遺傳時,在GC+GG型與CC型兩組之間有顯著性差異(P=0.004,P<0.01)。
  (4)不同基因型間臨床參數(shù)的比較
  對這4個SNP位點在BMI、收縮壓、舒張壓、TC、TG、HDL、LDL間比較,

9、統(tǒng)計分析應用單因素方差分析,所得結果4個SNP位點的不同基因型間在這些臨床參數(shù)均無統(tǒng)計學意義。
  (5)4個SNP位點與心肌梗死的相關分析
  APOB基因的rs515135位點的三種基因型頻率在MI組和非MI組兩組之間有統(tǒng)計學差異(P=0.047,P<0.05),說明該位點與MI有關聯(lián)。
  (6) CAD相關的危險因素分析
  rs216172、高血壓、LDL與冠心病的發(fā)病風險相關(P<0.05),有統(tǒng)計學

10、差異;而OR值分別為1.479、1.737、1.782,是冠心病的危險因素。
  結論:
  對于延邊地區(qū)漢族人群中實驗研究結論:
  1.SMG6基因的rs216172位點(C/G)與冠心病的發(fā)病有相關性,其CC基因型可能對冠心病發(fā)病起保護性作用。
  2.LDLR基因的rs1122608位點(G/T)的T等位基因是冠心病的保護性基因。
  3.APOB基因的rs515135位點(G/A)與心肌梗死發(fā)病相

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