鵝SREBP-2基因的克隆及禽HLH轉錄因子的分類和進化分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、SREBPs屬于堿性螺旋-環(huán)-螺旋亮氨酸拉鏈(basic helix-loop-helix leucine-zipper,bHLH-zip)轉錄因子家族,是真核細胞內調節(jié)脂質合成的關鍵核轉錄因子。本研究測定了朗德鵝(Anser anser)與天府肉(Anser cygnoides)SREBP-2基因的部分mRNA序列,得到了bHLH-zip基序的氨基酸序列,以此為基礎研究了生物體內HLH蛋自家族的特點和分類;以雞的基因組為代表,研究了鳥

2、類基因組內HLH轉錄因子的分類和進化。 序列提交到GenBank數據庫中,登陸號為EF579754和EF579755。經比對,兩品種鵝序列的相似性100%。 SREBP-2基因bHLH-zip基序在不同物種間保持高度的相似性,通過和其他物種的比較,發(fā)現發(fā)現5、14、23、25、28、32、54位點存在氨基酸多態(tài)位點。在和其它HLH轉錄因子比較時,發(fā)現鵝SREBP-2的bHLH-zip基序是一個不含脯氨酸(P)的HLH結構

3、,這種現象還有待進一步研究。 利用鵝SREBP-2 bHLH-zip基序為基礎,對HLH蛋白進行分類。結果在基因組中搜索到18種相關結構域,它們和HLH蛋白的功能密切相關,在進化中又保持了相對的獨立性。這是基因組進化過程中存在的一種“結構域洗排”的機制。 以雞的基因組為代表,研究了鳥類基因組中HLH轉錄因子的分類和進化。發(fā)現在雞的基因組中,HLH轉錄因子包含28個蛋白家族,可以分為A、B、C、D、E五類。在進化上A和D接

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